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福贡县地处滇西北横断山脉中段碧罗雪山和高黎贡山之间的怒江峡谷。东与兰坪县和维西傈僳族自治县交界，南与泸水县相连，西与缅甸接壤，北与贡山独龙族怒族自治县相邻。边境线长142.218公里。位于东经98°41′～99°02′，北纬26°28′～27°32′之间。南北比较大纵距112公里，东西比较大横距23公里。全县总面积2756.44平方公里。全县地势北高南低，怒江由北向南纵贯全境，形成一个从北向南狭长的“V”字型谷地。县内比较高点在碧罗雪山的嘎拉拍山峰，海拔4379米，比较低点在与泸水县交界处的怒江江面，海拔1010米，相对高差达3369米。县城驻地上帕镇海拔1190.9米。 福贡县气候垂直变化显著，从南到北有南、中、北亚热带和南温带等气候类型。受印度洋季风气候和太平洋季风气候的双重影响，形成了春季和夏秋间两个雨季的独特气候环境。2004年，县城年平均气温16.9℃，年均降雨量1443.3毫米，年日照1479.9小时，相对温度84，无霜期267天。

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